Pihak Kantor Kesyahbandaran dan Otoritas Pelabuhan (KSOP) Labuan Bajo kini tengah melakukan investigasi mendalam terkait kelayakan jalan KM Putri Sakinah. Insiden ini mempertegas pentingnya pemeriksaan rutin mesin kapal, terutama saat memasuki musim penghujan yang sering disertai angin kencang.
BMKG juga kembali mengeluarkan peringatan dini terkait gelombang tinggi di wilayah perairan NTT. Otoritas setempat mengimbau seluruh pemilik kapal wisata untuk memperketat standar keselamatan dan selalu memantau perkembangan cuaca sebelum memutuskan untuk berlayar demi mencegah tragedi serupa terulang kembali.