Beberapa pengamat menilai bahwa kepemimpinannya dapat:
- memperkuat dominasi kelompok garis keras di Iran
- mempererat hubungan antara pemerintah dan militer
- memperpanjang ketegangan dengan negara Barat
Namun di sisi lain, banyak pihak juga menilai masa depan Iran di bawah kepemimpinannya masih penuh tanda tanya.
Karena hingga kini, sosok Mojtaba Khamenei masih menyimpan banyak misteri yang belum sepenuhnya terungkap kepada publik dunia.